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      今天是2023年3月30日 星期四,歡迎光臨本站 

      真核有參轉錄組測序

      技術介紹       數據分析       經典案例       常見問題



      技術簡介



             轉錄組測序是指將特定狀態下的特定組織或細胞的所有mRNA提取,并進行建庫測序,得到所有mRNA表達信息的一種技術手段。轉錄組測序能夠動態反映基因的轉錄情況,與常規基因芯片不同的是,轉錄組除了能得到基因的表達量外,還能夠得到轉錄本的可變剪切,融合基因,位點突變,同時能夠發現未報道的新轉錄本。目前,該技術已經成為高通量獲得基因表達情況的主要手段。轉錄組測序打破了物種限制,無需提前得到基因組信息,也無需設計探針,可獲得任何物種的轉錄本信息。真核有參轉錄組測序,是將獲得的序列直接比對到參考基因組上,進而進行后續分析。




      數據分析


       

                  基因表達水平分析

                  差異基因表達分析    差異基因GO/KEGG分析    蛋白網絡分析    基因共表達分析

                  基因結構水平分析

                  可變剪切分析    融合基因分析    Snp/InDel分析    新轉錄本預測





      樣本要求



      細胞 ≥5×106個; 組織 ≥40mg; Total RNA ≥5ug



      實驗周期



      30天



             生因生物分析團隊已完成上千個項目的個性化數據分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測序平臺,可為研究者提供多樣化的測序和個性化的數據分析服務。多篇文獻發表在Nature、Science、Cell等頂級期刊,平均影響因子達到6。


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