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相關文獻
經典案例
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轉錄組測序揭示地黃與環烯醚萜合成相關的基因
研究背景
大鼠常作為化學毒性及藥物作用機理研究的模式生物，但我們對大鼠的各個器官、各個發育階段的轉錄信息還不太了解。本研究使用轉錄組測序技術對大鼠各器官各階段的320個樣本進行測序分析。地黃是古代廣泛使用的一種中草藥，富含生物活性環烯醚萜。盡管具備巨大的藥用性，我們對這種植物合成環烯醚萜相關的分子知識一無所知。為了研究它的基因組，并且研究與環烯醚萜相關的基因，我們進行了大規模的平行測序。
研究方法
研究結果
1 基因GO富集分析
2 基因PATHWAY富集分析。
研究結論
生物信息學分析發現了一系列的基因與環烯醚萜合成相關。一些僅在萜類吲哚生物堿的植物中表達的基因的同源基因也被鑒定出來，這一發現說明，環烯醚萜合成途徑II與途徑I在其合成的早些階段共享某些酶。使用qPCR對4種異戊烯轉移酶進行定量分析發現它們也在地黃中發揮作用。本研究后續環烯醚萜合成研究提供了重要信息。
參考文獻
Transcriptome Analysis Reveals Putative Genes Involved in Iridoid Biosynthesis in Rehmannia glutinosa. [International Journal of Molecular Sciences, 2012]
