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相關文獻
技術介紹
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技術簡介
長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一類長度大于200nt的非編碼RNA分子。近幾年研究發現lncRNA能夠與蛋白質、DNA、RNA等相互作用，參與多種生物學過程的調控，在腫瘤、疾病發生及機體發育過程中扮演著重要作用。
長鏈非編碼RNA測序（LncRNA Sequencing）是通過去除rRNA,構建鏈特異性文庫，對mRNA及lncRNA進行高通量測序的一種技術，能夠分析不同實驗條件下mRNA及lncRNA的即時表達情況。該技術可以精確到單個核苷酸的分辨率，同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本，獲得轉錄本的可變剪切，位點突變等信息，已成為lncRNA高通量鑒定和定量的主要手段。
數據分析
mRNA表達水平分析
基因差異表達分析 差異表達基因GO/KEGG分析 蛋白網絡分析 基因共表達分析
lncRNA表達水平分析
lncRNA差異表達分析 novel lncRNA鑒定 cis作用靶基因預測 trans作用靶基因預測 lncRNA序列保守性分析
基因結構水平分析
可變剪切分析 融合基因分析 Snp/InDel分析
技術路線：
樣本要求
細胞 ≥5×106個；組織 ≥40mg；Total RNA ≥5ug
實驗周期
35天
生因生物分析團隊已完成上千個項目的個性化數據分析，依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測序平臺，可為研究者提供多樣化的測序和個性化的數據分析服務。多篇文獻發表在Nature、Science、Cell等頂級期刊，平均影響因子達到6。
