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相關文獻
經典案例
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案例1 長鏈非編碼RNA和增強子RNAs調控人單核細胞脂多糖誘導的炎癥反應
研究背景
非編碼RNA是一類新的調控生物學過程的分子，其在人的免疫反應中的作用還不太清楚。因此，本研究對人單核細胞使用RNA測序技術進行非編碼RNA測序。
研究方法
研究結果
1 lncRNA鑒定。a:lncRNAs鑒定流程圖；c:單核細胞、Gencode v13及HumanBodyMap中lncRNAs分布；d：lncRNAs差異表達火山圖；e：鑒定lncRNAs在基因上的位置分布。
2 編碼蛋白鑒定。a：火山圖展示LPS刺激的單核細胞與未刺激的單核細胞的差異；b：RNA-seq與芯片分析結果的相關性；c：差異結果的KEGG富集分析。
研究結論
本研究共得到了76個 enhancer RNAs，40個canonical lncRNAs，65 antisense lncRNAs，35 個 bidirectional 轉錄本在響應細菌脂多糖時發生了顯著差異變化。當下調eRNAs (IL1b-eRNA)、RBT (IL1b-RBT46)時，減少了mRNA的產生，削弱了促炎癥反應介導因子IL1b和CXCL8的釋放。并預測lncRNAs在人的先天性免疫反應中是一個重要的調控因子。
案例2 健康人群中lncRNA比蛋白編碼基因表現出更高的表達量變異
研究背景
lncRNA逐漸被認為與基因調控密切相關，并且可能會比蛋白編碼基因的數量多。雖然，已經報道了大量的lncRNAs，但由于其具有較強的組織特異性和表達量較低的特性，其注釋一直不太完善。同時，個體表達量的變異也是一個重要的因素。本研究探討了lncRNA在人原發粒細胞中表達的變異性。
研究方法
研究結果
lncRNA個體間表達差異聚類熱圖。
研究結論
需要更全面的對這些低表達和高組織特異性的lncRNA進行注釋。同時，當我們對人類的lncRNA進行深入的注釋或者將其用于預后或疾病的標志物時，也要考慮到個體之間lncRNA表達的差異。
參考文獻
1、Long non-coding RNAs and enhancer RNAs regulate the lipopolysaccharide-induced inflammatory response in human monocytes. [nature communications, 2014]
2、Long non-coding RNAs display higher natural expression variation than protein-coding genes in healthy humans. [Genome Biology, 2014]
