經典案例
-
案例1 circRNA在外泌體中廣泛而穩定的存在,可作為潛在的癌癥診斷標志物
研究背景
近些年來發現circRNA是一種廣泛分布的內源性非編碼RNA,能夠調控基因表達。circRNA具有細胞、組織甚至發育階段特異性。外泌體中存在著很多蛋白質,mRNA,microRNA,這些物質調控著細胞的行為,可能會作為疾病診斷標志物。而外泌體中的circRNA卻沒有被報道過。本研究首次通過circRNA測序鑒定外泌體中的circRNA種類。
研究方法
研究結果
1 細胞與細胞外泌體中的circRNA。
2 人血液外泌體circRNA在基因組上的分布。
研究結論
本研究揭示了外泌體中的一類新的RNA分子circRNA,并且發現癌癥病人血清中的外泌體circRNA與正常人的外泌體circRNA顯著不同,可能會成為一類有效的癌癥診斷標志物。
案例2 circRNA是一大類具有調控潛能的RNA分子
研究背景
circRNA是一類較為神秘的尚未弄清功能的RNA分子,為了系統的研究circRNA,本研究對人、小鼠和線蟲進行了測序。
研究方法
研究結果
lncRNA個體間表達差異聚類熱圖。a:circRNA鑒定原理圖;b,c:人多個類型細胞中circRNA的數量;d:circRNA在基因組上的分布。
研究結論
需要更全面的對這些低表達和高組織特異性的lncRNA進行注釋。同時,當我們對人類的lncRNA進行深入的注釋或者將其用于預后或疾病的標志物時,也要考慮到個體之間lncRNA表達的差異。本研究鑒定了大量的表達良好,穩定存在,同時具有組織和發育階段特異性的circRNA。另外,發現了一種來源于CDR1as基因的circRNA,具備強力吸附miR-7的能力,顯示出circRNA能夠通過調節miRNA的表達量調節基因的功能。
參考文獻
2、Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency. [Nature, 2013]