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經典案例
深入分析膀胱癌中差異表達lncRNAs和circRNA的共同表達和ceRNA網絡
研究背景
膀胱癌是最常見的泌尿系統癌癥，在不同的國家均具有較高的發病率和死亡率。目前膀胱癌已經是第七男性最常見的癌癥。根據全球癌癥統計每年約新增440,000名確診的膀胱癌患者，并且有130,000名患者死于膀胱癌。膀胱癌在中國的發病率和死亡率在過去的幾十年逐年上升，已經成為發病率最高的泌尿系統癌癥和死亡率僅次于直腸癌的惡性癌癥。人的基因組中大約有5%-10%的序列會被轉錄，其中約有10-20%是編碼蛋白的RNA，其余80-90%是不編碼蛋白的RNA。近年來越來越多的研究表明非編碼轉錄本在癌癥的發病和發育過程中起著非常重要的作用。
研究方法
對膀胱癌與癌旁的lncRNA、circRNA和mRNA進行高通量分析。
研究結果
1 A,B,C分別是lncRNAs,circRNAs,mRNAs的表達量聚類熱圖。
2 A：mRNA GO富集分析；B：mRNA PATHWAY富集分析；C：通路網絡圖。
3 A：上調circRNA來源基因的GO富集分析；B：下調circRNA來源基因的GO富集分析。
4 mRNA與lncRNA共表達網絡分析。
5）ceRNA網絡分析。
研究結論
本研究發現了幾種與膀胱癌發生發展相關的lncRNAs和circRNAs，可能成為臨床診斷分子標志物。同時，有些lncRNAs、circRNAs分子可能用于膀胱癌的診斷和治療，具有重要的生物學意義。
參考文獻
Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. [Oncotarget, 2016]
