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經典案例
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單細胞測序技術揭示人鼠早期胚胎發育基因程序
研究背景
哺乳動物早期胚胎發育是一個復雜的過程涉及到轉錄層面架構的巨大變化。在此，我們使用單細胞測序技術對人和鼠從卵母細胞桑葚胚期到進行了深入的轉錄組動態變化分析。
研究方法
研究結果
1 a：無監督層次聚類圖；b：不同階段基因表達量主成分分析；c：單細胞胚胎與桑椹胚的相關性分析；d：單細胞期激活79個基因在各個時期的表達量聚類熱圖。
2 a：WGCNA分析各模塊層次聚類圖；b：熱圖展示7313個基因在7個階段的表達量熱圖。
3 a：不同數據獲得的各個階段保守得分熱圖；b：人與鼠各模塊間的相關性。
研究結論
本研究說明，單細胞測序技術可有效提高人胚胎細胞轉錄組定量水平。研究極大的擴展了我們對人類早期胚胎轉錄組架構、基因激活順序、遺傳編程的認識。多物種研究揭示了人早期胚胎發育的轉錄機制是高度保守的，是一種進化上的保守分子過程，包括一些關鍵基因的驅動。通過共表達模塊分析也看到了人跟鼠的一些不同。
參考文獻
Genetic programs in human and mouse early embryos revealed by single-cell RNA sequencing. [Nature, 2013]
