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相關文獻
經典案例
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自閉癥全基因測序鑒定新的突變
研究背景
新的突變在自閉癥基因圖譜紊亂中是很重要的，但是目前的分析僅局限在1.5%左右的編碼基因上。本研究，我們對200個自閉癥的父母孩子進行了全基因的測序，并鑒定了生殖突變和體細胞突變。
研究方法
研究結果
1 新突變序列分析。a：不同類型的突變轉換與顛換的比例；b：不同的新突變的堿基替換情況。
2 自閉癥新突變的來源。a：父母雙方來源的生殖突變和體細胞突變；b：父母來源突變會隨著父親年齡的增加而增加，而母親沒有顯著影響；c：個體內與個體間突變的距離；d：拷貝數突變。
3 基因組范圍內新突變的影響。a：有危害的新突變富集在編碼區與非編碼區域都；b：非編碼區域的新突變在DNase I激活區域顯著富集。c：GO富集。
研究結論
我們發現大部分新的突變來源于父親，隨著年齡的增加而增加。而，附近的新突變，多來源于母親，常伴隨著新的拷貝數的變異。相較于對照，發現一個顯著的富集，大約15.6%和22.5是非編碼的和遺傳非編碼的。非編碼的突變多富集的基因非編碼區域，外顯子跳躍的調控區域和DNaseI敏感區域。使用芯片或其他的檢測方式，我們也發現2/185自閉癥人群中存在異常的甲基化。我們的數據展示了不同的基因組范圍上的新突變，并提高了對自閉癥人編碼基因突變的認識。
參考文獻
Genome-wide characteristics of de novo mutations in autism. [Npj Genomic Medicine, 2016]
