常見問題
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1 全基因組測序與全外顯子組測序有什么優勢?
答:外顯子組測序捕獲基因組的外顯子區域,其基因組信息約占基因組大小的1.5%;全基因組測序對于全基因組層面來說,變異信息更全面可進行CNV、SV等分析。近些年非編碼區突變的研究越來越多,其可與多種癌癥在內的復雜疾病發生相關。同時,兩者的價格差不多,全基因組測序使用逐漸變得更加頻繁。
2 全基因組測序的測序深度多少合適?
答:測序深度根據研究目的、樣本量、實驗設計確定。通常30×測序深度即可檢測絕大部分SNV,如果客戶的研究目的是尋找癌組織中較大的結構變異、少數腫瘤細胞攜帶的低豐度的突變,建議測序深度至少50×以上。
3 貴公司的分析除了標準分析,后續可以個性化分析?
答:生因生物首先會給客戶一個標準分析,標準分析涵蓋了絕大部分研究所需要的數據,通??梢詽M足需求。同時可提供數據非常規分析,可針對各個項目,各個實驗需求進行個性化分析。
4 實驗設計有什么要求嗎,需要做多少生物學重復嗎?
答:全基因組測序多是進行群體遺傳突變的檢測,為了減少個體差異的影響,應盡可能多的進行大人群分析。
5 準備樣品時,有什么注意事項呢?
答:收樣品時注意兩點,第一,保證能夠提供足量的基因組DNA,人基因組重測序要求 細胞 ≥5×106個,組織 ≥40mg,Total DNA ≥5ug;第二,保證DNA的完整性,DNA降解無法進行建庫測序,應注意收集樣品的規范操作。
6 項目周期是多久?
答:樣品合格情況下,為40天。