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相關文獻
經典案例
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使用限制性內切酶關聯的二代測序構建高密度的遺傳圖譜
研究背景
遺傳圖譜的構建和QTL的檢測對于提高植物的品質和繁殖能力是非常重要的。構建高密度和高質量的遺傳圖譜對于生產高品質的滿足人類的葡萄是很有幫助的。二代測序由于高通量和低廉價格已經廣泛的用于基因組的研究。限制性位點相關的DNA測序（RAD）將是一個有效的測序用于定位基因型。結合二代測序與RAD已經被證明對SNP標記的發展是很有效的。
研究方法
研究結果
1 限制性內切酶消化位點的分布。
2 F1代、親代有效的reads數目和覆蓋度。
3 組1-5（Z190×Beihong）連鎖分析。
4 基因型與表型共線性分析。
研究結論
本研究展示了RAD而二代測序用于F1代的基因型的開發，并且使用我們設計的SNP標記成功的開發了高密度和高質量的遺傳圖譜。細節分析顯示這種新的開發遺傳圖譜的方法可能會用于各種各樣的基因組的研究，比如QTL檢測，序列組裝和基因組比較。
參考文獻
Construction of a high-density genetic map for grape using next generation restriction-site associated DNA sequencing. [BMC Plant Biology, 2012]
