技術介紹
-
技術簡介
宏轉錄組測序是以環境中全部微生物為研究對象,通過提取環境中整個微生物群落的總RNA,利用高通量測序測序技術進行大規模測序,通過生物信息學分析,研究微生物與環境、與宿主相互之間的關系,它擺脫了傳統研究中微生物分離培養的技術限制。高通量測序平臺具有通量高、準確性高、速度快、信息全等特點,能夠顯著加快微生物轉錄組學研究的進程,并且在鑒定低豐度的微生物群落及種類,挖掘更多基因資源方面具有非常大的優勢。該技術常用來研究環境微生物的微生物-宿主互作、基因功能及代謝網絡等,已廣泛應用于微生物研究。相較于宏基因組,宏轉錄組能從轉錄水平研究復雜微生物群落變化,能更好的挖掘潛在的新基因、差異表達的基因及其功能以及代謝通路的構建。
技術優勢
1、無需對微生物進行分離培養,直接提取微生物群落總RNA;
2、可同時鑒定幾乎所有的微生物種類;
3、信息分析全面,除了對物種信息挖掘,還能得到重要基因的表達豐度,差異變化等進行分析;
4、可快速,高效,大樣本的對多個群落進行分析。
樣本要求
樣品濃度 RNA ≥50ng/μl;樣品總量 RNA ≥10μg
實驗周期
50天
生因生物分析團隊已完成上千個項目的個性化數據分析,依托Illumina Hiseq 2000、Illumina Hiseq 2500、Illumina Hiseq 4000等測序平臺,可為研究者提供多樣化的測序服務和個性化的數據分析服務。多篇文獻發表在Nature、Science、Cell等頂級期刊,平均影響因子達到6。