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SMRT DNA測序鑒定空腸彎曲桿菌基因組限制性修飾圖
研究背景
空腸彎曲桿菌是一種主要的人類腸胃炎致病菌。本研究分析了一株來自嚴重腸炎病人的F38011菌株，在基因組和蛋白質組的角度認識細菌的致病過程。
研究方法
研究結果
1 C. jejuni F38011菌株基因組圖。1.69M染色體基因組，以DnaA起始，1613編碼區域。
2 C. jejuni F38011菌株與NCTC11168基因組比較。A：ACT比較分析；B：兩種菌株（PR1-PR7）比較分析。
3 C. jejuni F38011菌株甲基化分析發現5個主要的甲基化修飾。
4 C. jejuni F38011菌株蛋白質組分析。A：LC-MS/MS分析蛋白質種類；B：基因組UniProt預測485個酶。
研究結論
空腸彎曲桿菌F38011菌株長度為1,691,939bp,GC含量為30.5%。使用三代測序和限制性內切酶數據庫分析F38011菌株基因組位點以及可能與DNA限制性修飾有關的酶。共發現5個甲基化修飾與基因組修飾有關。蛋白組學分析得到的多肽序列與推測的多肽序列相一致。本研究為分析空腸彎曲桿菌限制性修飾酶的精準功能奠定了基礎?？傊?，本研究的的結果有利于我們理解空腸彎曲桿菌基因組、甲基化譜和編碼能力。
參考文獻
Analysis of the Campylobacter jejuni Genome by SMRT DNA Sequencing Identifies Restriction-Modification Motifs. [Plos One, 2015]
